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本 所 公 告

賀!本所吳益群教授榮獲本校「學術研究成果傑出教師獎」!全體師生同賀!

賀!本所溫進德副教授榮獲本校104學年度「教學傑出獎」!全體師生同賀!

本 所 最 新 研 究 成 果

  • 阮雪芬老師發表論文 Identification of lncRNA functions in lung cancer based on associated protein-protein interaction modules. Scientific Reports  6:35939 (2016) 。長型非編碼核醣核酸 (long non-coding RNA, lncRNA) 在過去被認為是基因體中的圾垃 (junk) ,但這近幾年來發現, lncRNA 具有調控功能,會藉由不同的調控機制,參與許多重要的生物功能。然而,大部分的 lncRNA 的功能仍不清楚,為了加速 lncRNA 功能的研究,我們提出一套計算生物學分析流程,藉由尋找出 lncRNA 相關的蛋白質交互作用模組 (protein interaction module) ,來推論該 lncRNA 的功能。在此研究中,我們將此方法應用在探討肺癌中 lncRNA 的功能,發現此方法不但可以正確推論出已知功能的 lncRNA ,也找到一些可能參與肺癌細胞癌化過程的 lncRNA 。

  • 阮雪芬老師發表論文 Co-expression analysis identifies long noncoding RNA SNHG1 as a novel predictor for event-free survival in neuroblastoma.  Oncotarget  7:58022-37 (2016) 。 MYCN 的高度表現或者基因片段的放大 (amplification) ,會造成神經母細胞瘤 (neuroblastoma) 比較差的預後。在此研究,我們探索可能參與神經母細胞瘤 (neuroblastoma) ,且與 MYCN 放大相關的長型非編碼核醣核酸 (long non-coding RNA, lncRNA) 。我們利用共表現分析法 (co-expression analysis) ,找到一個名為 SNHG6 的 lncRNA ,其高表現也造成神經母細胞瘤病患有不好的預後,可作為新的預後預測因子。然而其分子機制與功能,仍需要進一步實驗設計來驗證。

  • 阮雪芬老師發表論文 Unveiling MYCN regulatory networks in neuroblastoma via integrative analysis of heterogeneous genomics data.  Oncotarget  7:36293-310 (2016) 。 MYCN 是轉錄因子,也是神經母細胞瘤 (neuroblastoma) 驅使基因之一,因此為理解 MYCN 如何驅使神經母細胞瘤的形成與尋找有效的治療標靶,須先了解整個 MYCN 的調控網路。在此研究,我們整合了各式基因體資訊,包含 RNA-seq, miRNA-seq, ChIP-seq, gene expression microarray ,以及 microRNA 調控基因與蛋白質交互作用等資訊,來建構 MYCN 調控網路。在此網路中,我們發現 MYCN 會藉由調控多條 microRNA ,來共同抑制腫瘤抑制基因 (tumor suppressor gene) 的表現,這幾個重要的調控,也許具有作為治療標靶的可能性。

  • 吳益群老師研究團隊發表論文”LIN-3/EGF promotes the programmed cell death of specific cells in Caenorhabditis elegans by transcriptional activation of the pro-apoptotic gene egl-1”PLOS Genetics (2014) 10(8):e1004513。他們利用線蟲研究細胞凋亡的調控機制,發現表皮生長因子(EGF)可以從細胞外活化表皮生長因子受器,啟動細胞內的訊息傳遞路徑,進而促進細胞凋亡。此機制顯示在生物發育過程中,細胞可以接受外來訊號進而決定細胞的生死命運。在人類細胞中,表皮生長因子普遍被認為具有抑制細胞凋亡與促進細胞生長的功能,對癌症形成有重要的角色,並因此發展出治癌的標靶藥物,但有少數研究發現人類表皮生長因子具有促進細胞凋亡之功能。他們的研究顯示此訊息傳遞機制在不同物種間可能具有高度保留性,並可做為進一步抗癌藥物的發展或是預後基礎。
  • 吳益群老師研究團隊發表論文” BLMP-1/Blimp-1 regulates the spatiotemporal cell migration pattern in C. elegans. ” PLOS Genetics (2014) 10(6):e1004428 。他們利用線蟲的端頂細胞來研究生物體如何精準調控體內特定的細胞要在何時移動及其移動的方向。他們建立了一個調控端頂細胞移動的基因網絡,這個網絡不但能將時間以及空間這兩種調節訊號整合在一起之外,還可將這些事件和生物體的整體發育同步,精準的調控著端頂細胞的遷徙,讓線蟲能有正常生殖腺。此外,他們也發現這個基因網絡內的基因在人類中有同源基因,且其蛋白質作用也相似,暗示著此基因網絡具演化意義。
  • 蔡懷楨老師發表的論文 miR-1 and miR-206 target different genes to have opposing roles during angiogenesis in zebrafish embryos. Nature Communications (accepted) (2013) 。利用 LAMP 釐清了具有相同 seed sequence 的 miR-1 miR-206 會辨識不同的 target 。 miR-1 藉由結合 seryl-tRNA-synthetase (SARS) 而進而促進血管發育,而 miR-206 則藉由結合 vegf 來抑制血管發育。
  • 周子賓老師發表 The Drosophila GOLPH3 homolog regulates the biosynthesis of heparan sulfate proteoglycans by modulating the retrograde trafficking of exostosins. Development 140, 2798-2807 (2013). 果蠅與人類 GOLPH3 高基氏體蛋白質調控 tumor suppressor genes, Exostosins , 在細胞內的 retrograde trafficking 運送,進行影響 HSPGs 的生合成結果與其他衍生性狀。 Exostosin 1 and 2 tumor suppressor genes 的突變是目前已知人類骨癌 Multiple Osteochondroma (MO) 的病理成因之一,此研究報導將提供 MO 骨癌研究的一條新途徑。
  • 王致恬老師發表的論文 Synaptotagmin I Regulates Patterned Spontaneous Activity in the Developing Rat Retina via Calcium Binding to the C2AB Domains. PLoS ONE 7(10):e47465 (2012). 發現在突觸前神經元調控胞吐作用的蛋白 Synaptotagmin I , 會藉由其鈣離子的感應功能 ,進而 調控發育中的視網膜波,顯示調控神經傳導物質釋放的分子可影響大規模神經網絡的活動。
  • 吳益群老師發表的論文 Integrin alpha PAT-2/CDC-42 Signaling Is Required for Muscle-Mediated Clearance of Apoptotic Cells in Caenorhabditis elegans . PLoS Genet. 8(5): e1002663 (2012) ,發現一個可以辨識並移除死細胞的基因作用途徑,並提供證據顯示不同的細胞 ( 如表皮細胞或肌肉細胞 ) 會使用不同的辨識分子來清除死細胞。
  • Huang HY, J. T. Liu, H. Y. Yan and H. J. Tsai * . 2012. Arl6ip1 Plays a Role in Proliferation during Zebrafish Retinogenesis. Cells Tissues Organs. (in press) (SCI journal)
  • Chen YH, H. C. Lee, R. J. Hsu, T. Y. Chen, Y. K. Huang, H. C. Lo, S. C. Hu, H. J. Harn, J. R. Jeng, C. K. Sun, S. Z. Lin and H. J. Tsai * . 2011. The toxic effect of Amiodarone on valve formation in the developing heart of zebrafish embryos. Reprod Toxicol . (in press) (SCI journal)

    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0890623811005296

  • 董桂書老師最近發表的論文”Nuclear localization of the meiosis-specific transcription factor Ndt80 is regulated by the pachytene checkpoint.” (Mol. Biol. Cell, Jun 1, 2011)被選為”Highlights from MBoC Selection”,也榮獲The Faculty of 1000 (F1000)推薦。

 

榮 譽 榜
  • 賀 本所 阮雪芬老師研究室張海妍同學榮獲  The travel grant award of the 75th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
  • 賀 本所 溫進德老師研究室張凱鈞同學榮獲第二十一屆生物物理研討會論文壁報競賽第一名。
  • 賀 本所 陳俊宏老師實驗室 徐嘉偉同學榮獲 第 31 屆生物醫學聯合學術年會優秀壁報論文獎。
  • 賀 本所 陳俊宏 老師實驗室 徐嘉偉 同學榮獲 第 24 屆細胞及分子生物新知研討會 優秀壁報論文獎
  • 賀 本所 阮雪芬老師實驗室 侯君里同學榮獲 第 31 屆生物醫學聯合學術年會優秀論文壁報獎。
  • 賀 本所 吳益群 老師實驗室 吳允哲 同學榮獲 第 24 屆細胞及分子生物新知研討會 優秀壁報論文獎
  • 賀 本所 吳益群 老師實驗室 蔡雅因 同學榮獲 第 24 屆細胞及分子生物新知研討會 優秀壁報論文獎
  • 賀 本所 吳益群 老師實驗室 吳美萱 同學榮獲 第 24 屆細胞及分子生物新知研討會 優秀壁報論文獎
  • 賀 本所 王致恬 老師實驗室黃一婷同學榮獲“林榮耀教授學術教育基金會壁報展示獎”。( 1040608 )
  • 賀 本所 阮雪芬老師實驗室 高士傑同學榮獲 第 30 屆生物醫學聯合學術年會優秀論文壁報獎。
  • 賀 本所 阮雪芬老師實驗室 郭子霆同學榮獲 第 30 屆生物醫學聯合學術年會優秀論文壁報獎。
  • 賀 本所 阮雪芬老師實驗室 陳瑋庭同學榮獲 第 30 屆生物醫學聯合學術年會優秀論文壁報獎。
  • 賀 本所 蔡懷楨老師實驗室 曾志維同學榮獲 第 30 屆生物醫學聯合學術年會優秀看板論文壁報獎競賽優良看板論文壁報獎。
  • 賀 本所 蔡懷楨老師實驗室 胡家榕同學榮獲 第 30 屆生物醫學聯合學術年會優秀看板論文壁報獎競賽優良看板論文壁報獎。
  • 賀 本所 吳益群 老師實驗室 曾彥婷 同學榮獲 第 23 屆細胞及分子生物新知研討會 優秀壁報論文獎
  • 賀 本所 吳益群 老師實驗室 江銘仁 同學榮獲 第 23 屆細胞及分子生物新知研討會 優秀壁報論文獎
  • 賀 本所 阮雪芬老師研究室張心儀博士榮獲日本學術振興會外國人特別研究員獎助 (JSPS Fellowship)。
  • 賀 本所 阮雪芬老師研究室張心儀博士和陳卓逸同學榮獲科技部補助赴國外從事博士後研究 (1031128)。
  • 賀 本所 阮雪芬老師研究室張心儀博士, 黃振綜及王建凱同學榮獲2014 台灣蛋白體年會暨轉譯與系統生物學研討會優秀海報獎。
  • 賀 本所 蔡懷楨老師研究室博士生 曾志維榮獲第十二屆 The 12th Meeting of the Asian-Pacific Society for Neurochemistry (APSN)論文壁報金牌組第一名;註: Tokuji Ikenaka Award for Best Poster Presentations總共錄取金牌及銀牌各三名,有93篇poster參與競賽.。(1030901)
  • 賀 本所 阮雪芬老師研究室胡家瑋博士榮獲  The travel grant of the 73rd Annual Meeting of the Japanese Cancer Association 。
  • 賀 本所 阮雪芬老師研究室許家郎博士榮獲  The travel grant of the 73rd Annual Meeting of the Japanese Cancer Association 。
  • 賀 本所 阮雪芬老師研究室陳卓逸同學榮獲15th International Conference on Systems Biology (ICSB2014) Student bursary (Travel Award)。
  • 賀 本所 阮雪芬老師研究室胡家瑋博士榮獲第十九屆生物物理研討會論文競賽優等獎。
  • 賀 本所 蔡懷楨 老師實驗室李國智同學榮獲第29屆生物醫學聯合學術年會優秀看板論文壁報獎競賽 優良看板論文壁報獎。
  • 賀 本所 蔡懷楨老師實驗室陸柏年博士榮獲 Aquatic Animal Models for Human Disease and Midwest Zebrafish Meeting 2013 Postdoctoral Poster Award 。
  • 賀 本所 蔡懷楨老師實驗室曾志維同學榮獲 2013 年中華民國基礎神經科學學會學術年會壁報獎。
  • 賀 本所 阮雪芬老師研究室許家郎博士和陳卓逸同學榮獲 The 7th Asia Young Researchers Conference on Computational and Omics Biology (AYRCOB 2013) Travel Award。
  • 賀 本所 阮雪芬老師研究室胡家瑋博士榮獲 The 12th Human Proteome Organisation World Congress (HUPO 2013) Travel Award。
  • 賀 本所 阮雪芬老師實驗室 張心儀博士和許家郎博士分別榮獲第十八屆生物物理研討會 論文競賽 第一名和第二名。
  • 賀 本所 阮雪芬老師實驗室 張心儀博士和夏頡仁同學榮獲2013台灣蛋白質體學會年會暨國際轉譯醫學新知研討會壁報論文獎第三名。
  • 賀 本所 王致恬老師實驗室 姜寧同學榮獲“林榮耀教授學術教育基金會壁報展示獎”。(1020520)
  • 賀 本所 阮雪芬老師實驗室 徐寬豪同學榮獲第二十八屆生物醫學聯合學術年會 優秀論文壁報獎。
  • 賀 本所 吳益群 老師實驗室徐綜遠博士榮獲博士後學術著作獎。
  • 賀 本所 吳益群 老師實驗室李孟怡同學榮獲第21屆細胞及分子生物新知研討會的壁報論文比賽 優秀壁報論文獎。
  • 賀 本所 阮雪芬老師榮獲 2012 年中華民國資訊學會李國鼎穿石獎。
  • 賀 本所 阮雪芬老師研究室張心儀同學,榮獲日本學術振興會 5th HOPE Meeting with Nobel Laureates的獎助。
  • 賀 本所 阮雪芬 老師榮獲2012年中華民國資訊學會最佳博士論文指導教授獎 (1011214)
  • 賀 本所 王致恬 老師實驗室陳鈺杰同學榮獲“林榮耀教授學術教育基金會壁報展示獎”。(1010702)
  • 賀 本所 蔡懷楨 老師實驗室陳筱雯同學榮獲第26屆生物醫學聯合學術年會優秀看板論文壁報獎競賽 優良看板論文壁報獎。
  • 賀 本所 蔡懷楨 老師實驗室張文彥同學榮獲第26屆生物醫學聯合學術年會優秀看板論文壁報獎競賽 優良看板論文壁報獎。
  • 賀 本所 蔡懷楨 老師實驗室張文彥同學榮獲第19屆細胞與分子生物新知研討會 優秀壁報論文。
  • 賀 本所 蔡懷楨 老師實驗室盧慕蓉同學榮獲第20屆細胞與分子生物新知研討會 優秀壁報論文。
  • 賀本所 阮雪芬 老師研究室博士生 張心儀榮獲 " 70th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association ( JCA )" Grant Award。(1001108)
  • 賀本所蔡懷楨老師實驗室張文彥同學榮獲 第19屆細胞及分子生物新知研討會壁報論文優秀獎。(1000609)
  • 賀本所阮雪芬老師實驗室王宣凱同學榮獲第十六屆生物物理研討會論文競賽第三名。(1000523)
  • 賀本所阮雪芬老師實驗室 碩一新生吳怡萱同學及博士班曾建偉同學皆榮獲2011轉譯醫學國際研討會暨台灣蛋白體年會壁報論文獎。(1000429)
  • 賀本所阮雪芬老師實驗室 莊凱能同學榮獲第26屆(2011年)生物醫學聯合學術年會--論文競賽優良論文。(1000415)
  • 賀本所王致恬老師實驗室江重威同學,榮獲美國威斯康辛大學麥迪遜分校生物物理博士班入學許可及全額獎學金。(1000222)
  • 賀本所吳益群老師實驗室徐綜遠同學,榮獲第二十屆王民寧獎之[國內醫藥研究所博士 班優秀論文獎]。(1000103)
  • 賀本所吳益群老師實驗室卓峻逸同學,榮獲國家公費留學獎學金。(1000103)
  • 賀本所阮雪芬老師實驗室張心儀同學,榮獲 生化分生學會2010北港溪秋令營壁報論文獎 。(991115)
  • 賀本所阮雪芬老師實驗室陳成諭同學,榮獲第十五屆生物物理聯合研討會論文競賽優等獎。(990607)
  • 賀本所 蔡懷楨 老師實驗室吳如蕙同學, 本所楊西苑老師實驗室翁宗睿同學, 本所 阮雪芬老師實驗室許仲誠同學,榮獲第二十五屆生物醫學聯合學術年會榮獲優良看板論文壁報獎。( 990422 )
  • 賀本所 蔡懷楨 老師實驗室楊子慶、陳大淵同學,榮獲第二十三屆生物醫學聯合學術年會看板論文榮獲優秀獎。( 970618 )
  • 賀本所 蔡懷楨 老師實驗室許仁駿同學,榮獲第十六屆細胞及分子生物新知研討會壁報論文榮獲優秀獎。( 970618 )
  • 賀本所 阮雪芬 老師研究室碩士生 張心儀 通過審查獲選為 " 第四屆國際合成生物學研討會 (SB4.0: The Fourth International Conference on Synthetic Biology)" 口頭論文發表,並榮獲 BioBricks Foundation SB4.0 Travel Award 。( 970707 )
  • 賀本所 阮雪芬 老師研究室碩士生 張心儀 榮獲 “ 林榮耀 教授學術教育基金會壁報展示獎 ” 。( 970703 )
  • 王致恬 老師研究室碩士畢業生高韶巖獲德國 International Max Plank Research School 分子與細胞生物學 (IMPRS-LS) 之 Ph. D. 入學許可及全額獎學金。 (104/4)
  • 阮雪芬 老師研究室博士畢業生 張心儀獲聘為 日本京都大學藥學院博士後研究員 。 (104/4)
  • 阮雪芬 老師研究室碩士畢業生   吳怡萱同學獲 University of Florida 的博士班全額獎學金 , Michigan State University 和 Johns Hopkins University 碩士班入學許可 。 (104/3 )
  • 阮雪芬 老師研究室博士畢業生胡家瑋獲聘為University of Wisconsin–Madison博士後研究員。 (103/11)
  • 王致恬 老師研究室碩士畢業生姜寧獲得美國羅格斯大學(Rutgers University)神經科學Ph. D. 之入學許可及全額獎學金。(102/5)
  • 王致恬 老師研究室碩士畢業生陳鈺杰獲得美國加州大學河濱分校(University of California, Riverside)細胞生物學及神經科學Ph. D. 之入學許可及全額獎學金。(102/5)
  • 阮雪芬 老師研究室博士畢業生黃翠琴獲聘臺北醫學大學癌症生物學與藥物研發博士學位學程助理教授 (101/8)
  • 王致恬 老師研究室碩士畢業生任心怡獲得美國德州休士頓貝勒醫學院(Baylor College of Medicine)發育生物學Ph.D之入學許可及全額獎學金。(10107)
  • 賀本所畢業生 張哲維 獲得美國威斯康辛大學麥迪遜分校 (University of Wisconsin-Madison)Department of Physiology Ph.D. 之入學許可及全額獎學金。 (980317)
  • 賀本所畢業生 王維 君 獲得美國西北大學( Northwest University ) Neuroscience Program Ph. D. 之入學許可 及全額獎學金。 (970618)
大學生專題研究專欄
  • 阮雪芬老師指導之生化科技系大學生周蒂同學獲得 Johns Hopkins University  的  Bioinformatics  碩士班入學許可。
  • 阮雪芬 老師指導之電機系大學生陳龍輝同學獲得 獲史丹福 (Stanford) 大學電腦科學系碩士班入學許可 。  (104/3 )
  • 阮雪芬 老師指導之生科系大學生夏頡仁同學獲得Graduate Field of Biochemistry, Molecular & Cell Biology (BMCB), Cornell University 的Ph.D. program 六年全額獎學金。
  • 阮雪芬 老師指導之生科系大學生黃鼎育同學申請通過科技部大專學生專題研究計畫。
  • 阮雪芬 老師指導之生科系大學生夏頡仁同學申請通過國科會大專學生專題研究計畫。
  • 周子賓 老師指導之生科系大學生王紹芳同學榮獲“行政院國家科學委員會100年度大專學生研究計畫研究創作獎”。(1010719)
  • 阮雪芬 老師研究室 生科系大學生吳怡萱和林秀娟 申請通過國科會大專學生暑期專題研究計畫。( 991115 )
  • 阮雪芬 老師研究室生科系大學生 莊凱能 申請通過國科會大專學生暑期專題研究計畫。( 970703 )
  • 賀本所 王致恬 老師申請通過國科會大專學生暑期專題研究計畫(參與學生: 生科系 江重威)。 (970618)

 

灣大學分子與細胞生物學研究所
地址:(106) 臺北市羅斯福路四段一號
電話:886-2-33662475~7 傳真:02-3366247
8
E-mail:ntuclsimcb@ntu.edu.tw
 

 




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分子與細胞生物學研究所

104 學年度論文壁報競賽評審結果

獎項 姓 名
傑出獎
舒玟綺
傑出獎
王柏鈞
優良獎
張凱鈞
優良獎
徐嘉偉
佳作
黃亭穎
佳作
嚴家鴻

 


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