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本 所 最 新 研 究 成 果
  • 蔡懷楨老師發表的論文 miR-1 and miR-206 target different genes to have opposing roles during angiogenesis in zebrafish embryos. Nature Communications (accepted) (2013) 。利用 LAMP 釐清了具有相同 seed sequence 的 miR-1 miR-206 會辨識不同的 target 。 miR-1 藉由結合 seryl-tRNA-synthetase (SARS) 而進而促進血管發育,而 miR-206 則藉由結合 vegf 來抑制血管發育。
  • 阮雪芬老師發表的論文 Quantitative Proteomics Reveals Diverse Roles of miR-148a from Gastric Cancer Progression to Neurological Development. Journal of Proteome Research 12(9):3993-4004 (2013) , 利用定量蛋白質體學解析受微型 RNA miR-148a 所調控的蛋白質功能不只與胃癌的形成有關 , 更發現其與神經發育有關 , 進而以臨床資料和斑馬魚為模式加以證明 , 研究結果顯示在阿滋海默症和巴金森氏症病人的 miR-148a 表現量較正常人少 , 抑制 miR-148 表現後的斑馬魚腦部會不正常發育 , 此結果為首次揭露 miR-148a 在神經發育上所扮演的角色 。
  • 阮雪芬老師發表的論文 Quantitative Proteomic Analysis of Human Lung Tumor Xenografts Treated with the Ectopic ATP Synthase Inhibitor Citreoviridin. PLoS ONE 8(8):e70642 (2013) , 發現 ATP 合成酉每會表現於肺癌細胞膜上,加入其抑制劑 citreoviridin 會導致肺癌細胞生長受抑制,但對於正常細胞卻沒有影響 ; 本研究以定量蛋白質體學 、 統計方法和癌症動物模式實驗加以證明 citreoviridin 會誘導葡萄糖代謝相關酵素的蛋白質變化 , 它降低糖解作用中間產物的生成而促使大分子無法生合成 , 進而抑制肺癌細胞的增生 , 此結果有助於解釋為何 ATP 合成酉每抑制劑 citreoviridin 有抗肺癌的效用 , 並在癌症治療上提供代謝和腫瘤生成間關聯性的解釋 。
  • 阮雪芬老師發表的論文 Identification of microRNA 395a in 24-epibrassinolide-regulated root growth of Arabidopsis thaliana using microRNA arrays. International Journal of Molecular Sciences 14:14270-14286 (2013) ,利用微型核糖核酸微陣列結合基因表現微陣列和生物資訊 , 鑑定出植物賀爾蒙油菜固醇 ( Brassinosteroids) 會正向調控微型核糖核酸 miR395a 的表現 ,並透過抑制其標靶蛋白質 GUN5 的表現 , 而 在阿拉伯芥的幼苗和根生長中扮演重要角色 。
  • 阮雪芬老師發表的論文 Link clustering reveals structural characteristics and biological contexts in signed molecular networks. PLoS ONE 8(6): e67089 (2013) ,揭露正負向分子網路的結構特徵和生物意義 , 這個研究發現正向連結傾向於聚集在一起 , 然而負向連結較常是正向群聚的連結橋梁 ; 含有較高親和力的正向連結傾向於分享蛋白質區域 , 造成蛋白質複合體的內部聯繫 , 而負向連結則較傾向於造成蛋白質複合體間的聯繫 。 這些結果指出特殊正負號的測量有助於我們釐清網路結構的特徵和這些符號連結所隱藏的生物意義 。
  • 周子賓老師發表 The Drosophila GOLPH3 homolog regulates the biosynthesis of heparan sulfate proteoglycans by modulating the retrograde trafficking of exostosins. Development 140, 2798-2807 (2013). 果蠅與人類 GOLPH3 高基氏體蛋白質調控 tumor suppressor genes, Exostosins , 在細胞內的 retrograde trafficking 運送,進行影響 HSPGs 的生合成結果與其他衍生性狀。 Exostosin 1 and 2 tumor suppressor genes 的突變是目前已知人類骨癌 Multiple Osteochondroma (MO) 的病理成因之一,此研究報導將提供 MO 骨癌研究的一條新途徑。
  • 阮雪芬老師發表的論文 MicroRNA-Regulated Protein-Protein Interaction Networks and Their Functions in Breast Cancer. International Journal of Molecular Sciences 14:11560-11606 (2013) ,分析微型核醣核酸及核醣核酸之差異表現量,運用統計方法分析其相關性,進而得知微型核醣核酸調控之蛋白質交互作用網路,最後以接收者操作特徵 (ROC) 曲線和乳癌存活率來驗證預測結果,本研究發現新的與乳癌相關之微型核醣核酸及其功能。
  • 阮雪芬老師發表的論文Differential MicroRNA Regulation Correlates with Alternative Polyadenylation Pattern between Breast Cancer and Normal Cells. PLoS ONE 8(2): e56958 (2013),分析乳癌細胞及正常細胞的高通量定序資料,並利用統計方法計算,在癌細胞中微型核醣核酸表現量增加會使微型核醣核酸標地核醣核酸的長異構體易被分解,因而造成長短異構體比率變低;替代多聚腺(艸甘)酸化模式會導致微型核醣核酸異構體具不同長度的三端未轉譯區域,本篇文章提供證據解釋為何微型核醣核酸在從正常細胞轉變成癌化細胞的替代多聚腺(艸甘)酸化模式轉移中扮演重要的角色。
  • 阮雪芬老師發表的論文 Middle Infrared Radiation Induces G2/M Cell Cycle Arrest in A549 Lung Cancer Cells. PLoS ONE 8(1): e54117 (2013) , 指出中紅外光會 抑制肺腺癌細胞生長 , 同時也 顯示中紅外光可藉由改變細胞骨架,並透過活化 DNA 傷害引起有關的調控路徑而抑制細胞周期進行 ,這個研究提供癌症治療有用的資訊。 本篇文章獲選為 PLoS 部落格癌症研究宣傳照 ( http://blogs.plos.org/everyone/2013/04/02/plos-one-goes-to-washington-d-c-for-aacr-come-visit-us/ )
  • 阮雪芬老師發表的論文 ValidNESs: a database of validated leucine-rich nuclear export signals. Nucleic Acids Research 41(D1):D338-D343 (2013) ,建立一個新的資料庫 ValidNESs ,提供實驗證實之富含亮氨酸核輸出信號的蛋白質。染色體區域維護 1 ( CRM1 )調節的核輸出路徑和其貨物蛋白 (cargo proteins) 與疾病相關,最近幾年更已經被認為具有治療的潛力,本資料庫可提供生物學家可信且有用的研究資料。
  • 阮雪芬老師發表的論文 Lengthening of 3'UTR increases with morphological complexity in animal evolution . Bioinformatics 28(24):3178-3181 (2012) ,藉由分析後生動物的 mRNA 轉錄產物結構,測量每個物種細胞型態的數目而觀察到三端未轉譯區域的長度和型態的複雜性有一個驚人的指數關係,進而推論在後轉錄調控迴路上,三端未轉譯區域的長度和其相當的指數擴張對於在動物進化上新細胞型態的出現具有極大貢獻。
  • 阮雪芬老師發表的論文 Phosphoproteomic analysis of Rhodopseudomonas palustris reveals the role of pyruvate phosphate dikinase phosphorylation in lipid production . Journal of Proteome Research 11(11):5362-5375 (2012) ,首次分析光合菌 Rhodopseudomonas palustris 磷酸化蛋白質體 , 並發現 此菌在光合異營生長過程中, 丙酮酸磷酸二激酉每藉由調節蘇氨磷酸化,而 在 生質能源原料脂質生合成上 扮演重要角色。
  • 王致恬老師發表的論文 Synaptotagmin I Regulates Patterned Spontaneous Activity in the Developing Rat Retina via Calcium Binding to the C2AB Domains. PLoS ONE 7(10):e47465 (2012). 發現在突觸前神經元調控胞吐作用的蛋白 Synaptotagmin I , 會藉由其鈣離子的感應功能 ,進而 調控發育中的視網膜波,顯示調控神經傳導物質釋放的分子可影響大規模神經網絡的活動。
  • 阮雪芬老師發表的論文 Ectopic ATP synthase blockade suppresses lung adenocarcinoma growth by activating the unfolded protein response. Cancer Research 72(18):4696-4706 (2012) ,確定了在肺癌細胞膜異位 ATP 合成酉每的分子功能,並提供證據顯示電子傳遞鏈蛋白複合體同時也出現在肺癌細胞膜上,為肺癌標靶治療提供一個新的契機。
  • 阮雪芬老師發表的論文 Revealing the molecular mechanism of gastric cancer marker Annexin A4 in cancer cell proliferation using exon arrays. PLoS ONE 7(9):e44615 (2012) ,揭露膜聯蛋白 A4 在胃癌細胞增生上所扮演的角色及其調控路徑。
  • 阮雪芬老師發表的論文 Helicobacter pylori disrupts host cell membranes, initiating a repair response and cell proliferation. International Journal of Molecular Sciences 13 :10176-10192 (2012) ,發現幽門桿菌會破壞胃細胞膜,並啟動膜的修補作用,最終導致細胞增生,此結果提供幽門桿菌致使胃癌形成的可能原因之一。
  • 阮雪芬老師發表的論文 Crosstalk between transcription factors and microRNAs in human protein interaction network. BMC Systems Biology 6(1):18 (2012) ,闡明轉錄因子和微型核醣核酸在人類蛋白質網路上具有交叉影響之共同調控作用。
  • 阮雪芬老師發表的論文 Revealing the anti-tumor effect of artificial miRNA p-27-5p on human breast carcinoma cell line T-47D. International Journal of Molecular Sciences 13 :6352-6369 (2012) ,提供證據顯示人工的微型核醣核酸在抗乳癌細胞的效用和可能作用機制。
  • 吳益群老師發表的論文 Integrin alpha PAT-2/CDC-42 Signaling Is Required for Muscle-Mediated Clearance of Apoptotic Cells in Caenorhabditis elegans . PLoS Genet. 8(5): e1002663 (2012) ,發現一個可以辨識並移除死細胞的基因作用途徑,並提供證據顯示不同的細胞 ( 如表皮細胞或肌肉細胞 ) 會使用不同的辨識分子來清除死細胞。
  • 吳益群老師發表的論文 C. elegans EIF-3.K Promotes Programmed Cell Death through CED-3 Caspase. PLoS ONE , 7(5): e36584 (2012) ,發現一個轉譯蛋白複合體的成員 EIF-3.K 會促進細胞凋亡,並預測該蛋白造成細胞凋亡的作用機制。
  • Huang HY, J. T. Liu, H. Y. Yan and H. J. Tsai * . 2012. Arl6ip1 Plays a Role in Proliferation during Zebrafish Retinogenesis. Cells Tissues Organs. (in press) (SCI journal)
  • Chen YH, H. C. Lee, R. J. Hsu, T. Y. Chen, Y. K. Huang, H. C. Lo, S. C. Hu, H. J. Harn, J. R. Jeng, C. K. Sun, S. Z. Lin and H. J. Tsai * . 2011. The toxic effect of Amiodarone on valve formation in the developing heart of zebrafish embryos. Reprod Toxicol . (in press) (SCI journal)

    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0890623811005296

  • Lee HC, Y. J. Chen, Y. W. Liu, K. Y. Lin , S. W. Chen, C. Y. Lin, Y. C. Lu, P. C. Hsu, S. C. Lee S and H. J. Tsai * . 2011. Transgenic zebrafish model to study translational control mediated by upstream open reading frame of human chop gene. Nucleic Acids Res. 39, e139. (in press) (SCI journal)

    http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0890623811005296

  • 董桂書老師最近發表的論文”Nuclear localization of the meiosis-specific transcription factor Ndt80 is regulated by the pachytene checkpoint.” (Mol. Biol. Cell, Jun 1, 2011)被選為”Highlights from MBoC Selection”,也榮獲The Faculty of 1000 (F1000)推薦。
  • 吳益群老師最近發表的論文Engulfment of apoptotic cells in C. elegans is mediated by integrin alpha/src signaling, Curr. Biol. 20:477-486 (2010),首 度在生物體的層次上揭露integrin可辨識死細胞,作為吞噬受器,Curr. Biol.期刊邀 請知名學者Drs. Veera D'mello 與Raymond B. Birge 為該篇論文撰寫“Dispatch” Curr. Biol. 20: R324-327 (2010)。
  • 吳益群老師與中研院張煥正老師合作,發表論文 In vivo imaging and toxicity assessments of fluorescent nanodiamonds in Caenorhabditis elegans. Nano Lett. 10:3692-3699 (2010),首度利用線蟲來評估螢光奈米鑽石在活體生物的毒性與 光學成像的應用,科學界的網路新聞PhysOrg.com以“Nanodiamonds could be used in disease diagnosis”為題(http://www.physorg.com/news203230792.html),撰文報導該篇論文。Discovery news 也以“Swallowing diamonds could find what’s ailing you”為題 (http://news.discovery.com/tech/nano-diamonds-diagnose-swallow.html),報導該篇論文。


 

榮 譽 榜
  • 賀 本所 阮雪芬老師研究室陳卓逸同學榮獲15th International Conference on Systems Biology (ICSB2014) Student bursary (Travel Award)。
  • 賀 本所 阮雪芬老師研究室胡家瑋博士榮獲第十九屆生物物理研討會論文競賽優等獎。
  • 賀 本所 蔡懷楨 老師實驗室李國智同學榮獲第29屆生物醫學聯合學術年會優秀看板論文壁報獎競賽 優良看板論文壁報獎。
  • 賀 本所 蔡懷楨老師實驗室陸柏年博士榮獲 Aquatic Animal Models for Human Disease and Midwest Zebrafish Meeting 2013 Postdoctoral Poster Award 。
  • 賀 本所 蔡懷楨老師實驗室曾志維同學榮獲 2013 年中華民國基礎神經科學學會學術年會壁報獎。
  • 賀 本所 阮雪芬老師研究室許家郎博士和陳卓逸同學榮獲 The 7th Asia Young Researchers Conference on Computational and Omics Biology (AYRCOB 2013) Travel Award。
  • 賀 本所 阮雪芬老師研究室胡家瑋博士榮獲 The 12th Human Proteome Organisation World Congress (HUPO 2013) Travel Award。
  • 賀 本所 阮雪芬老師實驗室 張心儀博士和許家郎博士分別榮獲第十八屆生物物理研討會 論文競賽 第一名和第二名。
  • 賀 本所 阮雪芬老師實驗室 張心儀博士和夏頡仁同學榮獲2013台灣蛋白質體學會年會暨國際轉譯醫學新知研討會壁報論文獎第三名。
  • 賀 本所 王致恬老師實驗室 姜寧同學榮獲“林榮耀教授學術教育基金會壁報展示獎”。(1020520)
  • 賀 本所 阮雪芬老師實驗室 徐寬豪同學榮獲第二十八屆生物醫學聯合學術年會 優秀論文壁報獎。
  • 賀 本所 吳益群 老師實驗室徐綜遠博士榮獲博士後學術著作獎。
  • 賀 本所 吳益群 老師實驗室李孟怡同學榮獲第21屆細胞及分子生物新知研討會的壁報論文比賽 優秀壁報論文獎。
  • 賀 本所 阮雪芬老師榮獲 2012 年中華民國資訊學會李國鼎穿石獎。
  • 賀 本所 阮雪芬老師研究室張心儀同學,榮獲日本學術振興會 5th HOPE Meeting with Nobel Laureates的獎助。
  • 賀 本所 阮雪芬 老師榮獲2012年中華民國資訊學會最佳博士論文指導教授獎 (1011214)
  • 賀 本所 王致恬 老師實驗室陳鈺杰同學榮獲“林榮耀教授學術教育基金會壁報展示獎”。(1010702)
  • 賀 本所 蔡懷楨 老師實驗室陳筱雯同學榮獲第26屆生物醫學聯合學術年會優秀看板論文壁報獎競賽 優良看板論文壁報獎。
  • 賀 本所 蔡懷楨 老師實驗室張文彥同學榮獲第26屆生物醫學聯合學術年會優秀看板論文壁報獎競賽 優良看板論文壁報獎。
  • 賀 本所 蔡懷楨 老師實驗室張文彥同學榮獲第19屆細胞與分子生物新知研討會 優秀壁報論文。
  • 賀 本所 蔡懷楨 老師實驗室盧慕蓉同學榮獲第20屆細胞與分子生物新知研討會 優秀壁報論文。
  • 賀本所 阮雪芬 老師研究室博士生 張心儀榮獲 " 70th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association ( JCA )" Grant Award。(1001108)
  • 賀本所蔡懷楨老師實驗室張文彥同學榮獲 第19屆細胞及分子生物新知研討會壁報論文優秀獎。(1000609)
  • 賀本所阮雪芬老師實驗室王宣凱同學榮獲第十六屆生物物理研討會論文競賽第三名。(1000523)
  • 賀本所阮雪芬老師實驗室 碩一新生吳怡萱同學及博士班曾建偉同學皆榮獲2011轉譯醫學國際研討會暨台灣蛋白體年會壁報論文獎。(1000429)
  • 賀本所阮雪芬老師實驗室 莊凱能同學榮獲第26屆(2011年)生物醫學聯合學術年會--論文競賽優良論文。(1000415)
  • 賀本所王致恬老師實驗室江重威同學,榮獲美國威斯康辛大學麥迪遜分校生物物理博士班入學許可及全額獎學金。(1000222)
  • 賀本所吳益群老師實驗室徐綜遠同學,榮獲第二十屆王民寧獎之[國內醫藥研究所博士 班優秀論文獎]。(1000103)
  • 賀本所吳益群老師實驗室卓峻逸同學,榮獲國家公費留學獎學金。(1000103)
  • 賀本所阮雪芬老師實驗室張心儀同學,榮獲 生化分生學會2010北港溪秋令營壁報論文獎 。(991115)
  • 賀本所阮雪芬老師實驗室陳成諭同學,榮獲第十五屆生物物理聯合研討會論文競賽優等獎。(990607)
  • 賀本所 蔡懷楨 老師實驗室吳如蕙同學, 本所楊西苑老師實驗室翁宗睿同學, 本所 阮雪芬老師實驗室許仲誠同學,榮獲第二十五屆生物醫學聯合學術年會榮獲優良看板論文壁報獎。( 990422 )
  • 賀本所 蔡懷楨 老師實驗室楊子慶、陳大淵同學,榮獲第二十三屆生物醫學聯合學術年會看板論文榮獲優秀獎。( 970618 )
  • 賀本所 蔡懷楨 老師實驗室許仁駿同學,榮獲第十六屆細胞及分子生物新知研討會壁報論文榮獲優秀獎。( 970618 )
  • 賀本所 阮雪芬 老師研究室碩士生 張心儀 通過審查獲選為 " 第四屆國際合成生物學研討會 (SB4.0: The Fourth International Conference on Synthetic Biology)" 口頭論文發表,並榮獲 BioBricks Foundation SB4.0 Travel Award 。( 970707 )
  • 賀本所 阮雪芬 老師研究室碩士生 張心儀 榮獲 “ 林榮耀 教授學術教育基金會壁報展示獎 ” 。( 970703 )
  • 王致恬 老師研究室碩士畢業生姜寧獲得美國羅格斯大學(Rutgers University)神經科學Ph. D. 之入學許可及全額獎學金。(102/5)
  • 王致恬 老師研究室碩士畢業生陳鈺杰獲得美國加州大學河濱分校(University of California, Riverside)細胞生物學及神經科學Ph. D. 之入學許可及全額獎學金。(102/5)
  • 阮雪芬 老師研究室博士畢業生黃翠琴獲聘臺北醫學大學癌症生物學與藥物研發博士學位學程助理教授 (101/8)
  • 王致恬 老師研究室碩士畢業生任心怡獲得美國德州休士頓貝勒醫學院(Baylor College of Medicine)發育生物學Ph.D之入學許可及全額獎學金。(10107)
  • 賀本所畢業生 張哲維 獲得美國威斯康辛大學麥迪遜分校 (University of Wisconsin-Madison)Department of Physiology Ph.D. 之入學許可及全額獎學金。 (980317)
  • 賀本所畢業生 王維 君 獲得美國西北大學( Northwest University ) Neuroscience Program Ph. D. 之入學許可 及全額獎學金。 (970618)
大學生專題研究專欄
  • 阮雪芬 老師指導之生科系大學生夏頡仁同學獲得Graduate Field of Biochemistry, Molecular & Cell Biology (BMCB), Cornell University 的Ph.D. program 六年全額獎學金。
  • 阮雪芬 老師指導之生科系大學生黃鼎育同學申請通過科技部大專學生專題研究計畫。
  • 阮雪芬 老師指導之生科系大學生夏頡仁同學申請通過國科會大專學生專題研究計畫。
  • 周子賓 老師指導之生科系大學生王紹芳同學榮獲“行政院國家科學委員會100年度大專學生研究計畫研究創作獎”。(1010719)
  • 阮雪芬 老師研究室 生科系大學生吳怡萱和林秀娟 申請通過國科會大專學生暑期專題研究計畫。( 991115 )
  • 阮雪芬 老師研究室生科系大學生 莊凱能 申請通過國科會大專學生暑期專題研究計畫。( 970703 )
  • 賀本所 王致恬 老師申請通過國科會大專學生暑期專題研究計畫(參與學生: 生科系 江重威)。 (970618)

 

灣大學分子與細胞生物學研究所
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電話:886-2-33662475~7 傳真:02-3366247
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E-mail:ntuclsimcb@ntu.edu.tw
 

NEW 103學年度博士班口試名單



最 新 公 告

103.06.05:102學年度論文壁報競賽評審結果,傑出獎-蕭愉恬、黃顥儀,優良獎-陳境峰、楊蕙如,佳作-蘇玫燕、林宛瑩、林盈均、陳昭儀、李明樺,以上共9位同學,分子與細胞生物學研究所 敬賀。

103.05.21:依據生命科學相關系所課程與教學委員會102學年第一次會議決議 「請將該次會議記錄有關碩士生教學實習改為相關系所必修及103學年開始實施」經本所課程委員會於5月21日開會決議通過,並於網路上公告。



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